Di Hunter: Space Pirates, kisah ini dimulai dengan seorang bocah berusia tiga tahun yang secara misterius terpisah dari ibunya. Bocah itu diambil oleh pasangan baik hati yang berduka atas kehilangan putra mereka, dan dia menemukan penghiburan dalam perawatan mereka. Ayah angkatnya, seorang pensiunan pilot tempur Angkatan Laut yang dijuluki "Viper", menginspirasi daya tarik anak laki -laki itu dengan pesawat terbang.
Namun, tragedi terjadi lagi ketika pasangan itu kehilangan nyawa mereka dalam pertemuan tragis dengan beruang grizzly. Sekarang di ambang remaja, bocah itu ditempatkan di rumah asuh baru, di mana ia harus beradaptasi dengan kehidupan bersama empat wanita. Saat ia menavigasi bab baru ini, interaksinya dengan para wanita di sekitarnya membentuk perjalanan penemuan diri dan pemahaman tentang hubungan, cinta, dan identitas.